การประยุกต์ใช้การวิเคราะห์เครือข่ายกับข้อมูลที่ได้รับจากธนาคารข้อมูลโปรตีนในโครงสร้างของโปรตีน 12 จาก 15 ตัวที่ติดเชื้อ HIV ผู้ตรวจสอบสามารถคำนวณคะแนนเครือข่ายสำหรับกรดอะมิโนแต่ละตัวซึ่งสะท้อนถึงจำนวนและความสำคัญสัมพัทธ์ของพันธบัตรกับกรดอะมิโนอื่น ๆ ในโปรตีน ยิ่งมีกรดอะมิโนในเครือข่ายมากเท่าไรก็ยิ่งมีโอกาสกลายพันธุ์น้อยลงในลำดับของไวรัสนับพัน

ที่นำมาจากผู้ป่วยซึ่งหมายความว่าสารตกค้างในเครือข่ายที่มีความสำคัญต่อการทำงานของไวรัส เพื่อทดสอบความหมายนั้นนักวิจัยได้ออกแบบการกลายพันธุ์เป็นกรดอะมิโนที่มีคะแนนเครือข่ายสูงและต่ำและพบว่าการกลายพันธุ์ของสารตกค้างที่มีเครือข่ายสูงนั้นทำให้ความสามารถในการติดเชื้อของเอชไอวีลดลง ในทางตรงกันข้ามการกลายพันธุ์กรดอะมิโนที่มีคะแนนเครือข่ายต่ำมีผลกระทบเพียงเล็กน้อยหรือไม่มีเลยต่อการติดเชื้อไวรัส โปรตีน Gag p24 ซึ่งมีความสำคัญต่อการสร้างเปลือกโปรตีนของไวรัสมีความถี่สูงสุดของกรดอะมิโนในเครือข่ายซึ่งสนับสนุนการศึกษาก่อนหน้านี้พบว่ามันไวกว่าโปรตีน HIV อื่น ๆ ต่อผลของการกลายพันธุ์และการตอบสนองของ T-cell การกำหนดเป้าหมาย Gag p24 สัมพันธ์กับระดับไวรัสที่ต่ำกว่า